南京中医药大学是一本大学，该校是GJ双一流建设高校和江苏省高水平大学建设高校，是江苏省人民政府与GJ中医药管理局共建高校。学校始建于1954年，是全国建校最早的高等中医药院校之一。
南京中医药大学不仅主持编写了第一套中医高等教育教材和教学大纲，也为新中国现代高等中医教育输送了第一批师资，培养并诞生了承淡安、叶橘泉等新中国中医药界最早的学部委员（院士），从这里走出了9位国医大师（占全国的三分之一）、5位中医药界院士（占全国的二分之一），被誉为新中国高等中医教育的摇篮。
截至2019年9月，学校有仙林和汉中门两个校区；各类在校生近2万名；设有10余个二级学院，33个本科专业，涉及医、管、理、工、经、文6个学科门类，形成了以中医药为主体、中西医结合、多学科为支撑协调发展的办学格局。