1、养料配制。金针菇的栽培由菌丝的发育开始，在种植之前，先要配制好培养料。培养料以棉籽壳为主要原料，加入适量的麦麸、石膏、木屑、玉米芯等材料，加入清水搅拌，连续搅拌三天，保证养料无霉变，自身新鲜干净。将选取的菌料放在专用的菌种袋中，放在高压环境下进行灭菌，喷洒少量的高锰酸钾溶液。
2、接种处理。处理好的培养料放入接种室中等待接种，将养料均匀铺在接种床上，铺上5-8厘米，铺设完成后进行降温处理，将温度保持在25℃左右。将菌种均匀的放入培养料中栽培，在上面覆盖一层透明的薄膜，注意，全程做好消毒工作。接种后，对温度、湿度、光照、通风进行管理，在出菌过程中，还需将养料中的菌种清除。
3、出菇管理。在培育出菇期间，室内的温度要随之下降，控制在10-15℃之间。当菌柄长到2公分时，要将湿度保持在90%左右，当长达10公分的时候，及时控制喷水，控制空气湿度保持在80%-85%左右。在出菇前2-3周，要保持室内流通的空气。
4、适时采收。金针菇发育成熟后应及时采收，一般情况下，一般长到12-15厘米时便可收获了。