大蒜经过高温烹饪时，其中的大蒜素和抗氧化成分会流失，因此生蒜的抗菌效果和抗氧化效果会更好，其有效成分基本都被保留下来了。但是大蒜被煮熟后，其含有的硫化合物蒜氨酸会更容易被人体吸收，能够有效抑制人体胆固醇的合成。
1、抗菌性
抗菌性是生蒜和熟蒜主要的功效差异之一，当温度高于80℃时，大蒜素会很难快失去作用，因此生蒜的抗菌效果会更好。
2、抗氧化能力
从生蒜和熟蒜的抗氧化能力来看，熟蒜经过100℃的温度烹饪后，它的抗氧化成分会大量流失，因此生蒜的抗氧化能力会更强。
3、降低胆固醇
大蒜经过高温加热煮熟后，虽然会破坏一部分营养成分，但是其中的硫化合物蒜氨酸会更容易被人体吸收，这种物质可以抑制胆固醇的合成，因此熟蒜的降胆固醇功效更强。